娘と息子への関わり方について

2歳5ヶ月の娘、3ヶ月の息子について相談させてください。
 娘は現在保育園に通っています。
息子は夕方からのグズりがひどく、夕方娘の保育園お迎えから帰ってから夜の寝かしつけまで基本抱っこ状態となります。 

夜寝る際、娘は添い寝だけで寝てくれるのですが、息子が寝てからでないと寝てくれません。
息子はラッコ抱き状態だと寝つきも良く寝かしつける必要もなく私自身も楽なので、寝かしつけの際は寝室を暗くし、息子を胸に乗せた状態で横になり、娘が一通り遊んで満足したら「ねんねだよー、おやすみー」と声をかけて寝るという感じでやっています。
ところが昨日主人から 「息子に過保護すぎる、娘が可哀想だ」と怒られました。
確かに娘からは布団に横になる前に抱っこを要求されたり、泣いたりすることもあるのですが、 「ごめんね、今はできないからギューしよう」とギューと抱きしめたり、息子が寝付いたら布団へ下ろして娘と一緒に寝たりしています。

 日中保育園に通っているため、娘とは一対一の状態で関わりたいとは思っているのですが、息子を抱っこしながらの状態が多く、なかなか出来ていません。
私としては2人を寝かしつける方法として現在の方法で寝かしつけをおこなっているのですが、やはり娘にはストレスを与えてしまっているのかなぁと思いつつもどうしたらいいのかも分からず…
やはり息子にかかりっきり過ぎなのでしょうか…

正解なんてものは無いのでしょうが、もしこうしたらどうかというようなアドバイスがありましたらお願いします。