起きている時に咳が出ます

しおりさん、おはようございます。
ご質問ありがとうございます。
お子さんの咳とくしゃみが気になるのですね。

今の時期、様々な細菌やウイルスが流行していますね。軽度な細菌感染やウイルス感染があると、咳が出ることがあります。ですが、この場合には、一時的なものではなく、1日を通して、断続的に咳症状がみられることが多いです。起きている時だけということであれば、感染症などの可能性は低いのかもしれませんね。
乳児の場合には、嚥下機能が未熟です。横になっている状態では、唾液などが喉の奥に溜まったり、胃の構造上、吐き戻しもしやすいため、気道に戻ってきた母乳やミルクが、喉の奥に戻ってきてむせることはよくありますよ。また、エアコンなどでお部屋の空気が乾燥していると、喉がイガイガしやすく、咳き込むことも考えられます。気管に何か入って咳き込むような場合には、ゲップをささていただく時のように、身体を起こしていただき、お背中を優しくトントンしていただくといいかと思います。また、喉が乾燥している場合には、加湿器を使用してお部屋の湿度を60%程度に保っていただくといいかもしれませんね。また、おっぱいであれば、時間に関係なく飲ませていただいて問題ないですので、少しこまめに授乳なさるのもいいですよ。成長とともに嚥下機能も発達してきますので、一時的なものと思いますが、もし呼吸が苦しそう、呼吸数が多い、顔色が悪い、元気がない、おっぱいやミルクの飲みが悪いなどの症状が見られましたら、小児科でご相談いただくと安心かと思いますよ。