ミルクを飲む量が減った

生後2ヶ月半の女の子を育てています。
ミルク寄り混合で、母乳を左右5分ずつ、ミルクは1回100mlを1日6回(夜よく寝たらたまに5回になりますが)あげています。
1〜2ヶ月は乳頭混乱気味で、母乳は途中で嫌がりましたが哺乳瓶ならしっかり飲む子で残すことはほぼなく、2ヶ月検診では体重増加も1日39gで順調でした。
しかし数日前から、哺乳瓶を咥えさせようとすると最初嫌がることが出てきて、その後は飲むのですが20〜30ml残すことが増えてきました。
未だ完飲することの方が多いのは多いのですが、元々全くといっていいほど残さない子だったので、なにか体調が悪いのでは？と不安に思いましたが、ミルク以外は全くいつも通りです。なお、哺乳瓶及び乳首は新生児の頃から変えていません。
乳頭混乱による母乳拒否は少し落ち着きましたが、代わりに遊び飲みをするようになったので、母乳もそこまでしっかり飲めてはいないように思うのですが…。
3ヶ月頃に満腹中枢が発達してくると聞いたのでミルクを残すことは分かるのですが、最初に嫌がる点が疑問です。
あと、思えば、嫌がるようになる数日前から、ミルクを飲み始めてすぐにむせることが何度かありました。また、かなり前からですがミルクの際にゴロゴロと痰が絡んだような呼吸音がなる点も気になっています。

ミルク直後に「お腹が空いた」と不機嫌にならなければ、多少残しても問題ないものでしょうか？2ヶ月前後からミルクで泣かなくなり、指を吸ったり不機嫌な声を上げるだけになってしまったため、そういったサインを全て受け取れているか自信もありません。
もし上記の情報から何か問題が見受けられ、前と同じように飲んでもらえるような改善策があるなら、アドバイスを頂きたいです。
よろしくお願いします。