母健カードについて

9月4日から嘔吐、頭痛などの症状から休んでおり落ち着いてきたかなと思ったら20日に発熱があり次の日にコロナ陽性が発覚しました。療養期間の5日が過ぎても頭痛、息苦しさが続いていて1週間経ってまた熱が出てしまい先週までずっと休んでいました。
妊婦健診は8月末と9月末に行きましたがコロナになったことは伝えましたがつわりで休んでいたことは伝えていません(この時は母健カードのことを把握してなかったのと休むほどじゃないと言われそうで相談できませんでした)
この場合は母健カードは書いてもらえませんよね？
会社からは今週いっぱい休んで休職するか復帰するか決めてと言われています…

上手くまとめられず文がごちゃごちゃになってしまいましたがよろしくお願いします。